Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NANOGQ9H9S0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGQ9H9S0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms