Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS7BQ9H9Q2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS7BQ9H9Q2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms