Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C10orf88Q9H8K7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C10orf88Q9H8K7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C10orf88Q9H8K7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms