Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC86Q9H6F5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC86Q9H6F5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms