Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRDQ9H2X0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRDQ9H2X0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRDQ9H2X0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRDQ9H2X0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.1 ms