Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM60Q9H2L4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms