Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LHX5Q9H2C1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX5Q9H2C1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX5Q9H2C1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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