Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC8Q9H0W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC8Q9H0W5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC8Q9H0W5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC8Q9H0W5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms