Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM5DQ9BY66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
KDM5DQ9BY66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM5DQ9BY66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5DQ9BY66 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms