Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCNM1Q9BWG6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCNM1Q9BWG6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNM1Q9BWG6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms