Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUP58Q9BVL2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NUP58Q9BVL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUP58Q9BVL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms