Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB2BQ9BVA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB2BQ9BVA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms