Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KATNB1Q9BVA0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KATNB1Q9BVA0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms