Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP8Q9BV40 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VAMP8Q9BV40 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms