Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM79Q9BSE2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM79Q9BSE2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM79Q9BSE2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM79Q9BSE2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms