Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM1Q9BR11 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM1Q9BR11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms