Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTP3Q9BQQ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTP3Q9BQQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTP3Q9BQQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTP3Q9BQQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms