Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX50Q9BQ39 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX50Q9BQ39 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX50Q9BQ39 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms