Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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KCNS3Q9BQ31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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KCNS3Q9BQ31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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KCNS3Q9BQ31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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KCNS3Q9BQ31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNS3Q9BQ31 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNS3Q9BQ31 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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