Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MEIS3Q99687 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MEIS3Q99687 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MEIS3Q99687 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MEIS3Q99687 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms