Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CGRRF1Q99675 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CGRRF1Q99675 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms