Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDX2Q99626 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDX2Q99626 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDX2Q99626 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDX2Q99626 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms