Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POP1Q99575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POP1Q99575 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POP1Q99575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POP1Q99575 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POP1Q99575 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POP1Q99575 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POP1Q99575 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POP1Q99575 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POP1Q99575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POP1Q99575 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POP1Q99575 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POP1Q99575 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POP1Q99575 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POP1Q99575 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POP1Q99575 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POP1Q99575 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POP1Q99575 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POP1Q99575 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
POP1Q99575 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POP1Q99575 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POP1Q99575 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
POP1Q99575 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POP1Q99575 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POP1Q99575 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
POP1Q99575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POP1Q99575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POP1Q99575 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POP1Q99575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POP1Q99575 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POP1Q99575 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POP1Q99575 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POP1Q99575 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POP1Q99575 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
POP1Q99575 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POP1Q99575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms