Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VAT1Q99536 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VAT1Q99536 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1Q99536 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms