Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EYA3Q99504 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EYA3Q99504 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EYA3Q99504 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms