Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF3RQ99062 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF3RQ99062 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF3RQ99062 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms