Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UHRF1Q96T88 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UHRF1Q96T88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UHRF1Q96T88 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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