Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PNKPQ96T60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PNKPQ96T60 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNKPQ96T60 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms