Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA13Q96PP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TSGA13Q96PP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSGA13Q96PP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms