Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FOXN4Q96NZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FOXN4Q96NZ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FOXN4Q96NZ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms