Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG3

TTC25, Tetratricopeptide repeat protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC25Q96NG3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TTC25Q96NG3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TTC25Q96NG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC25Q96NG3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms