Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLRP4Q96MN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLRP4Q96MN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLRP4Q96MN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms