Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
GJD4Q96KN9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
GJD4Q96KN9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
GJD4Q96KN9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
GJD4Q96KN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
GJD4Q96KN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms