Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM8Q96KF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM8Q96KF7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMIM8Q96KF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms