Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCORQ96JN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCORQ96JN0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCORQ96JN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms