Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCD1Q96GM5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMARCD1Q96GM5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCD1Q96GM5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCD1Q96GM5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMARCD1Q96GM5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms