Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ASIC4Q96FT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASIC4Q96FT7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASIC4Q96FT7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASIC4Q96FT7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms