Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00526Q96FQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms