Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINGO1Q96FE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINGO1Q96FE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINGO1Q96FE5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms