Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PABPC5Q96DU9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PABPC5Q96DU9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PABPC5Q96DU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms