Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC58Q96CX6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC58Q96CX6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms