Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIFAQ96CG3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TIFAQ96CG3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIFAQ96CG3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIFAQ96CG3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms