Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NSUN4Q96CB9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NSUN4Q96CB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NSUN4Q96CB9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms