Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
DHX58Q96C10 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DHX58Q96C10 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DHX58Q96C10 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DHX58Q96C10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms