Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RGMAQ96B86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RGMAQ96B86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RGMAQ96B86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms