Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFRSF25Q93038 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF25Q93038 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF25Q93038 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms