Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDS1Q92903 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDS1Q92903 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDS1Q92903 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms