Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD50Q92878 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAD50Q92878 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RAD50Q92878 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RAD50Q92878 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.9 ms