Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBXN4Q92575 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN4Q92575 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBXN4Q92575 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBXN4Q92575 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms