Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREK1Q8WXA9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREK1Q8WXA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREK1Q8WXA9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms